报
报 告 一：
报告题目：基于纳米孔测序技术的5mC检测方法
报告时间：2022年7月1日 上午9:30-10:30
报告地点：计算机楼313
报 告 人：倪鹏
报告摘要：
DNA 5mC甲基化是表观遗传学中的一个重要研究问题，其在染色质结构和组织水平上的生物过程中起主要作用。近年来三代测序技术（PacBio SMRT测序和Oxford 纳米孔测序）迅速发展。其中纳米孔测序的电信号对碱基修饰比较敏感，可以直接用来检测DNA甲基化，而无需额外实验技术。并且，纳米孔测序成本低廉，目前已逐渐成为主流的三代测序检测DNA甲基化的技术手段。本团队利用纳米孔测序数据，开发了基于深度学习的5mC检测方法，可准确预测出DNA CpG位点的甲基化状态。
报 告 二：
报告题目：基于高错误率长读数的二倍体组装方法
报告时间：2022年7月1日 上午10:30-11:30
报告地点：计算机楼313
报 告 人：聂藩
报告摘要：
基因组组装是基因功能分析，基因多样表达和调控分析，基因多样性分析等多种下游分析的基础。长读数的长度优势有利于组装出更连续的结果，但其较高的测序错误影响了组装质量。特别是组装二倍体物种时，测序错误会掩盖二倍体数据的单倍型差异，从而组装成一条单倍型混合的序列。因此完整地组装出二倍体的两个单倍型是一个巨大的挑战。本报告将介绍一种使用高错误率长读数的二倍体组装方法，它能够从测序错误中识别单倍型差异，从而完成对二倍体读数的纠错和组装。
